nhanes数据集的获取

生信分析(生物信息学)是一门研究生物学数据的科学，包括基因、蛋白质、转录组、表观遗传学和代谢组等数据。在选择用于生信分析的数据集时，需要考虑以下几个因素：

1. 研究目的：不同的研究目的可能需要不同类型的数据。例如，如果研究目的是寻找与疾病相关的基因突变，那么基因组测序数据可能更合适；而如果研究目的是探究基因表达模式，那么转录组数据可能更有价值。

2. 数据质量：确保所选数据集的质量对于准确解读数据至关重要。高质量的数据集通常具有较高的序列比对准确性、较低的错误率以及丰富的变异信息。

3. 数据覆盖范围：根据研究问题，选择具有一定覆盖范围的数据集可以提高分析结果的可靠性。例如，如果研究对象是某种特定物种，那么可以选择该物种的基因组或转录组数据作为研究基础。

4. 公开性和许可：在选择数据集时，需要关注其是否为公开数据或受特定许可协议约束。公开数据集通常免费提供，但可能存在一些限制；而受许可协议约束的数据集则需要遵守相应的使用规定。

以下是一些常见的生信分析数据集：

• Ensembl:一个广泛使用的基因组注释数据库，包含人类和其他物种的基因组序列及其注释信息。
• NCBI Gene Expression Omnibus (GEO):一个存储基因表达数据的数据库，涵盖了多种组织来源的RNA-seq和微阵列实验数据。
• The Cancer Genome Atlas (TCGA):一个关于癌症基因组学的研究项目，提供了大量肿瘤组织的基因组、转录组和表观遗传学数据。
• The Human Protein Genome Project (HGP):一个关于人类蛋白质组的研究项目，提供了人类蛋白质序列及其注释信息。
• The European Bioinformatics Institute (EBI) Gene Expression Omnibus (GEO):一个存储基因表达数据的数据库，涵盖了多种组织来源的RNA-seq和微阵列实验数据。
• NHANES：美国国家健康和营养调查计划(National Health and Nutrition Examination Survey, NHANES)的一部分，是一个长期的、前瞻性的健康研究项目。

这些仅仅是众多生信分析数据集的一部分，可以根据自己的研究需求进行选择。

NHANES

NHANES是美国国家健康和营养调查计划(National Health and Nutrition Examination Survey, NHANES)的一部分，是一个长期的、前瞻性的健康研究项目。自1972年开始，NHANES每年都会对美国数千名成年人进行健康评估和生物统计学数据收集。

NHANES数据集主要包括以下几个方面的信息：

• 生活方式：包括饮食习惯、锻炼情况、吸烟、饮酒等生活习惯的信息。
• 健康状况：包括慢性疾病、心理健康、睡眠、体重等方面的信息。
• 实验室检查：包括血压、血糖、血脂、肝功能、肾功能等实验室检查结果的数据。

NHANES数据集具有以下特点：

• 大规模：NHANES每年都会招募数万人参与调查，因此其数据规模非常庞大，可以提供丰富的生物统计学信息。
• 长期性：NHANES已经进行了超过40年的研究，因此可以提供长期的生物统计学数据，有助于了解人群的健康变化趋势。
• 多样性：NHANES涵盖了多种人群，包括不同年龄、性别、种族、教育水平和职业背景的人群，可以提供广泛的人群特征信息。

NHANES数据集在生信分析领域具有很高的应用价值，特别是在生物统计学和流行病学研究中。然而，需要注意的是，由于NHANES数据集的开放性和免费性，部分数据可能存在噪声或异常值，需要谨慎处理。

数据获取

nhanes数据集由美国疾控中心按调查周期进行发布，通常每2年为一个周期，但是前几年因为疫情打乱了节奏，从1999年到2018年的数据一直是2年一个周期。

美国疾病控制与预防中心(Centers for Disease Control and Prevention,简称CDC)是美国政府的一个公共卫生机构，隶属于美国卫生与公众服务部。CDC的主要任务是预防、控制和应对各种传染病、非传染性疾病以及健康相关事件。

CDC成立于1946年，其总部位于美国弗吉尼亚州兰多夫县的麦克莱伦。作为美国联邦政府的一级机构，CDC在全球范围内具有很高的声誉和影响力。它通过制定国家层面的健康政策、提供科学依据、进行疾病监测和预警、开展疾病预防和控制工作等，为维护美国民众的健康提供了重要支持。

此外，CDC还提供了大量的公共卫生信息和服务，如疫苗接种建议、疾病预防指南、健康教育资源等，以帮助公众更好地了解和管理自己的健康。

美国CDC官网为 https://wwwn.cdc.gov/ ，从官网上就可以找到nhanes数据集，具体页面地址为 https://wwwn.cdc.gov/nchs/nhanes/ ，从这个页面可以找到nhanes相关的各种信息，包括数据集的说明和下载链接。https://wwwn.cdc.gov/Nchs/Nhanes/Search/default.aspx ，这个是数据集搜索页面，很常用，可以检索数据集变量名称等信息。

从上述页面找到想要的数据文件后，点击现在链接即可下载，直截了当，完全免费。

不同的数据文件大小不一，下载时间有长有短，再加上网络波动，有时一个数据文件可能需要多次下载。这里提供一个比较完整的文件清单供参考：

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